全书采用思想分析和结构分析相结合的方法，
1,认为《矛盾论》以对立统一规律为核心，以矛盾的普遍性与特殊性、同一性与斗争性的关系为两翼。
2,以矛盾的特殊性为重点，以主要矛盾与次要矛盾、矛盾的主要方面和次要方面的相互转化为枢纽，形成“一体两翼”的理论结构。
3,《矛盾论》可以划分为三大部分：
靠前部分是关于两种宇宙观问题，阐述了两种宇宙观的根本对立、矛盾法则是唯物辩证法的根本法则等问题。
第二部分阐述了矛盾的普遍性和特殊性及其关系、主要矛盾和次要矛盾、矛盾的主要方面和次要方面及其相互转化等问题。
第三部分是关于矛盾的同一性和斗争性及其关系问题，阐述了矛盾的同一性和斗争性及其关系、对抗在矛盾中的地位等问题；
4,《矛盾论》关于主要矛盾和次要矛盾、矛盾的主要方面和次要方面相互转化的论述，则构成从矛盾的普遍性与特殊性及其辩证关系的论述，转化到矛盾的同一性与斗争性及其辩证关系论述的中介和枢纽。
5,《矛盾论》的总体理论结构呈现“一体两翼”的思想结构和“花开两朵、各表一枝”的文本结构，其每一部分则大体呈现为“原理阐述、例证分析、方**要求”的“三部曲”，体现出世界观与方**、辩证法与认识论、理论与实践高度统一的特征。
