（1）地理位置不同，哈尔滨工业大学本部位于黑龙江省哈尔滨市，而威海校区则位于山东省威海市；
（2）开设的专业不同，由于哈尔滨工业大学威海校区是后来建立的一所分校，所以其包含的专业比本部校区所包含的专业要少一些；
（3）录取的分数有一定的差距，因为建校地理位置不同，所以威海校区和本部校区的录取分数线有一定的不同，威海校区的部分专业录取分数线要高于本部校区。
哈尔滨工业大学威海校区和本部有以下区别
地理位置、校园环境等方面的差异。威海校区坐落在美丽宜居的海滨城市威海，校园占地面积1860余亩，比本部的5212.35亩小很多。
开设的专业数量不同。威海校区只有13个学院，开设的专业比本部少很多。
硬件设施等方面的差异。威海校区的实验室等硬件设施比本部少很多，大师讲座也比较少，研博培养体系弱于本部。
此外，威海校区的招生分数要低于本部，尽管近些年两者之间的差距在不断变小。威海校区的保研机会很多，研究生的去向也不错，很多威海校区的毕业生要去本部读研，而本部的学生流动到威海去读研的少。
