1、分类：黄芪属于补虚药中的补气药，而黄芩属于清热药中的清热燥湿药，一个作用是清，一个作用是补；2、性状不同：(包括形状，颜色，断面都不同);3、来源不同：黄芪是豆科植物黄芪的根，而黄芩是黄芩科植物黄芩的根。
