肾盂囊肿和肾囊肿的主要区别在于它们的位置和功能,肾囊肿是肾脏内一种常见的液体充满的囊状结构,可以发生在单侧或双侧肾脏,通常不会引起症状,只有在囊肿较大时才可能导致腰部不适,而肾盂囊肿则位于肾脏盂部,与肾小管相通,会影响尿液的正常流动,可能导致腰痛、发热等症状,需要及时治疗。