草鱼和青鱼的主要区别在于它们的体型、鳞片形状、侧线系统和鳍部特征，草鱼体型较大，侧线系统发达，尾鳍呈扇形；青鱼体型较小，侧线系统较弱，尾鳍分叉，草鱼鳞片细小，呈圆形；青鱼鳞片较大，呈椭圆形，两者均为底栖性鱼类，主要生活在水域的中下层。
