红霉素和阿奇霉素都属于大环内酯类的药物，但是两者还有以下几点区别：
1、抗菌活性和抗菌谱：红霉素抗菌活性弱，抗菌谱较窄，仅对肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌等革兰阳性菌以及肺炎支原体、衣原体、军团菌等非典型性病原菌有较强的抗菌活性，对革兰阴性菌和厌氧菌几乎没有作用，而且细菌对其容易产生耐药性。 阿奇霉素经过结构改造，对革兰阳性菌和非典型性病原菌的抗菌活性有所增强，而且对流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌、大肠杆菌、肺炎克雷白菌等革兰阴性菌以及脆弱拟杆菌等厌氧菌都有较强的抗菌活性，而且不易产生耐药性。
2、药物代谢：红霉素在肝脏中代谢成为羟基红霉素，再由肾脏排泄。 阿奇霉素则被肝脏完全代谢成为乙酰化代谢产物，再由肾脏排泄。
