数学与应用数学主修课程包括专业基础课、专业核心课和实践性教学环节。专业基础课包括但不限于数学分析、高等代数、解析几何、常微分方程、概率论与数理统计、复变函数等。专业核心课包括但不限于实变函数、泛函分析、数值分析、数学建模、抽象代数、拓扑学、随机过程、偏微分方程等。主要实践性教学环节包括但不限于专业技能实践、专业实习、毕业论文、创新项目和数学(建模)竞赛、数学强基训练等。