女性腰两侧疼痛的原因较多,具体如下:1、泌尿系统的疾病:此时需要考虑女性泌尿系统是否出现了问题,若女性有肾炎、肾积水、肾结石、输尿管结石、膀胱炎、膀胱结石、尿路感染等泌尿系统疾病,就会造成女性腰两侧疼痛;2、妇科以及盆腔的疾病:当有盆腔炎或者是宫颈糜烂等妇科疾病时,也会导致女性腰两侧疼痛;3、腰背肌筋膜炎和腰肌劳损:这两种疾病常是由于着凉、劳累而导致,可以有后腰部筋膜、肌肉的疼痛。