大活络丸与小活络丸的区别主要在于药效和适应症,大活络丸主要用于治疗风湿性关节炎、腰腿疼痛等症状,具有活血化瘀、舒筋活络的作用;而小活络丸则主要用于治疗跌打损伤、肌肉酸痛等症状,具有消肿止痛、散瘀止血的功效,大活络丸更适用于关节疼痛,小活络丸更适用于外伤损伤。