甲状腺肿大的原因有很多，其中最常见的是缺碘，致甲状腺肿物质包括卷心菜等十字花科蔬菜、木薯、含氟过多的饮水等；致甲状腺肿的药物包括甲巯咪唑等抗甲状腺药物(比如有甲亢的孕妈服用抗甲亢药物可导致胎儿甲状腺肿)、碳酸锂、胺碘酮等，遗传缺陷或基因突变也可能导致体内酶缺乏、或甲状腺球蛋白缺陷、或甲状腺激素受体缺陷等，影响甲状腺激素的合成，或影响甲状腺激素发挥正常作用，引起甲状腺代偿性肿大，身体对甲状腺激素的需求增加：青春期、孕期、哺乳期、更年期身体对甲状腺激素的需求量会有所增加，为了生产出更多的甲状腺激素，甲状腺会发生代偿性肿大，某些甲状腺疾病比如 Graves 病、桥本甲状腺炎、结节性甲状腺肿、甲状腺肿瘤等，都可以引起甲状腺肿大。
