MPA和MBA都是硕士学位，但是它们的定位不同，MPA是公共管理硕士，主要培养从事公共事物、公共管理和政策研究等方面的高级人才，为公共部门，特别是***机关和非盈利机构培养具有现代公共政策、公共事物理论素养，掌握先进分析方法及技术，精通某一具体政策领域的领导者、管理者和行政分析者 。 MBA是工商管理硕士，主要培养能够胜任工商企业和经济管理部门高层管理工作需要的务实型、复合型和应用型高层次管理人才 。
两者的课程设置也有很大的不同，MBA的课程设置更多地涉及到商业和金融领域，包括会计、市场营销、战略管理等；而MPA则更注重政治、社会和环境等方面的知识，包括公共政策、公共预算、城市规划等。
报考难度也有所不同，虽然两个项目的笔试考试内容一样，全国统一的试卷，但是考取的难度却相差很大，2023级MBA国家线为167分，而MPA是175分。
