每天早上起来肚子疼的原因有很多,可能是由于生理性因素,或者部分病理性因素造成,如肠道痉挛、慢性胃炎、十二指肠溃疡等导致,如果症状较重或频繁出现,建议及时到医院就诊,进行相关检查后明确病因,并对症治疗 。