要办理小作坊食品生产许可证,首先需要向当地市场监管部门提出申请,提交申请时需提供相关材料,如营业执照、卫生许可证、食品安全管理制度等,市场监管部门会对申请材料进行审核,符合条件的企业将接受现场检查,通过现场检查后,企业需按照规定购买相应的设备和原材料,并接受相关部门的抽检,市场监管部门会发放小作坊食品生产许可证,整个办理过程可能需要数月时间,具体以当地政策为准。