等位基因是一对同源染色体上，位置相同，控制相对性状的基因。原核细胞没有染色体，也没有同源染色体，因此原核细胞中也就没有等位基因。同源染色体及等位基因只存在于有性生殖的生物体内。进行无性生殖的生物体内既不具备同源染色体，也不具备等位基因。
