黑枸杞和红枸杞的主要区别在于颜色、形态和功效,黑枸杞呈黑色,果实较小,含有丰富的花青素,具有抗氧化、抗衰老、提高免疫力等作用;红枸杞呈红色,果实较大,含有丰富的胡萝卜素,具有滋补肝肾、明目、抗衰老等功效,两者在药用上可以相互替代,根据个人需求选择适合自己的品种。