国有独资企业与国有独资公司的主要区别在于所有权性质和治理结构,国有独资企业是指国家单独出资设立的企业,其资产属于国家所有,企业经营权由国家行使,国有独资公司的所有权也是国家所有,但其资本来源可以是国家、集体或私人投资,公司治理结构相对独立,具有法人地位,国有独资企业是国家对整个企业的控制,而国有独资公司则是国家对资本运作的控制。