南京大学研究生专业涵盖了哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12个学科门类,共计约60个一级学科,具体专业包括:哲学、政治经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、军事学、管理学、社会学、人类学、心理学、计算机科学与技术、软件工程、电子信息科学与技术、自动化、机械工程等。