菌类是一大类微生物的总称，包括了许多种类，根据生物学的分类方法，菌类大致可以分为两类：细菌和真菌，这两大类又各自包含了许多具体的子类。
细菌是单细胞的微生物，个体微小，形态多样，如球状、杆状、螺旋状等，常见的细菌有大肠杆菌、沙门氏菌、葡萄球菌等。
真菌则是多细胞的微生物，有的有成形的细胞核，有的没有，真菌的形态也非常多样，如酵母菌、霉菌、蘑菇等。
还有一些特殊的生物，如病毒，虽然它们在某种程度上也具有一些基本的细胞结构，但由于其复杂性和多样性，一般被归类为"非细胞结构的微生物"。
菌类的数量非常庞大，据估计，地球上已知的菌类大约有10万种以上，而实际存在的种类可能远超这个数字。
