革兰阴性菌和革兰阳性菌的主要区别在于它们的细胞壁结构和染色特性。
1、细胞壁结构：革兰阴性菌的细胞壁主要由厚重的肽聚糖层和较薄的脂多糖层组成，这使得革兰阴性菌在电镜下呈现紫色，而革兰阳性菌的细胞壁则由较薄的肽聚糖层和较厚的脂多糖层组成，使得革兰阳性菌在电镜下呈现红色。
2、染色特性：革兰阴性菌在染色过程中使用苯酚酸钾溶液会使菌体产生红色沉淀，而革兰阳性菌则会产生粉红色沉淀，这是因为革兰阴性菌的细胞壁没有足够的脂多糖层来吸收靛紫染料，而革兰阳性菌的细胞壁上的脂多糖层可以吸收靛紫染料。
3、氧化酶和过氧化氢酶：革兰阴性菌通常缺乏氧化酶和过氧化氢酶，这使得它们在生长过程中需要利用其他途径来产生能量，而革兰阳性菌通常具有这两种酶，因此它们能够通过氧化代谢来产生能量。
4、应用领域：由于革兰阴性菌和革兰阳性菌的结构和生理特性不同，它们在临床药物敏感性测试、细菌培养基配方以及生物工艺领域等方面有着不同的应用，青霉素类抗生素主要针对革兰阳性菌，而氨基糖苷类抗生素则主要用于抑制革兰阴性菌。
