巴楚县4个镇：巴楚镇、色力布亚镇、阿瓦提镇、三岔口镇8个乡：恰尔巴格乡、多提巴格乡、阿纳库勒乡、夏玛勒乡、阿克萨克马热勒乡、阿拉格尔乡、琼库尔恰克乡、英吾斯堂乡县境内有下河林场、兵团四十八团、兵团五十二团。
