医保和农村合作医疗是两种不同类型的医疗保险制度，它们的主要区别在于覆盖范围、缴费方式和待遇水平等方面。
在覆盖范围方面，医保主要针对城镇职工和城镇居民，包括国有企业、事业单位、私营企业等各类用人单位的员工以及城乡居民，而农村合作医疗则主要针对农村居民，特别是农村户籍的非劳动力人口，如农民、留守儿童等。
在缴费方式上，医保是由企业和个人共同缴纳的社会保险费用，其中企业按照一定比例缴纳，个人按照一定比例缴纳，而农村合作医疗则是由***、集体和个人共同筹集资金，个人只需缴纳一定的保费即可参加。
在待遇水平方面，由于医保的参保人数多、筹资规模大，因此其报销比例和待遇水平相对较高，医保可以报销门诊、住院、手术等多种医疗费用，而且报销比例较高，而农村合作医疗的报销比例相对较低，且只能报销部分基本医疗服务费用。
医保和农村合作医疗在覆盖范围、缴费方式和待遇水平等方面存在较大差异，医保主要针对城镇职工和居民，具有较高的报销比例和待遇水平；而农村合作医疗则主要针对农村居民，筹资规模较小，但参保门槛低，保障了农村居民的基本医疗需求。
