真核微生物是一类具有真正细胞核的微生物,包括细菌、古菌和真核真菌,细菌又包括革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、厌氧菌等;古菌主要包括放线菌、立克次氏体、衣原体等;真核真菌则包括酵母菌、霉菌等,这些微生物在生态系统中起着重要作用,如参与有机物分解、氮素循环等过程。