佛山科学技术学院目前拥有7个硕士点，分别是：计算机科学与技术、软件工程、电子信息科学与技术、管理科学与工程、环境科学与工程、材料科学与工程、生物医学工程。此外，学院还设有智能科学与技术、网络空间安全、经济管理、英语等多个硕士学位授权点。
