农业系统工程，是应用系统工程的理论和技术，对农业系统的规划、设计、试验、研究、调控及其应用过程进行科学管理的一门工程技术。
主要内容包括：
①系统目标的确定。总目标为创造更多的农产品和改善农业生态。系统各组成部分的具体目标如高产、优质、养地、防止水土流失和环境污染等；
②系统模型的建立。如农业系统优化，可采用线性规划、非线性规划或多目标规划模型；农业系统预测，可采用回归模型、动态规划模型、系统仿真模型或灰色系统模型等；
③系统求解及其结果评价。通过在计算机上的反复调试，可获得满意结果。而对结果的解释，主要依靠研究者本身的实践经验和在农业生产方面的知识素养。要正确处理定量与定性的关系，理论与实践的关系，寻求优秀方案。
