公章和合同专用章的主要区别在于使用范围和法律效力，公章是公司法人的法定印章，代表公司对外行使权利，其法律效力最高，而合同专用章主要用于合同签署和证明，其法律效力次于公章，公章通常需要备案，而合同专用章则无需。
