男性小肚子疼的原因有很多，可能是由于泌尿系统或生殖系统的疾病引起的，如膀胱炎、结石、尿潴留、前列腺炎、附睾睾丸炎等，如果您的小肚子疼是由于这些原因引起的，建议您及时就医，通过尿常规、腹部CT等检查，明确病因，进行对症、对因治疗。
