公证费的收取通常按照一定的比例或者固定的费用来计算，对于50万元的存款公证，其公证费的具体金额会因地区和具体的公证事项有所不同。
大部分地区的公证费用都会在1000元至4000元之间，如果需要对50万元的存款进行详细的说明或者附加其他证明材料，那么公证费用可能会更高，公证机构还可能根据你的需求提供额外的服务，如加急处理、特快服务等，这些服务也可能需要额外支付费用。
如果你想知道50万元存款的公证费用是多少，最准确的方式是直接联系你所在地的公证机构进行咨询，他们可以根据你的具体情况给出最准确的收费信息。
需要注意的是，虽然公证费是一项必要的开支，但它并不能完全反映出公证过程的风险，在进行任何形式的财产公证之前，都应该充分了解相关的法律法规，确保自己的权益得到有效保护。
