甲钴胺和维生素B12都是人体必需的营养素，但是它们的作用不同，甲钴胺属于内源性维生素B12,它存在人体的血液、髓液中，对神经元传导有良好的改善作用，其能促进核酸、蛋白的合成，并修复已经被损害的神经组织，而维生素B12则是一种外源性营养素，主要存在于动物性食品中，如肉类、鱼类、蛋类等，它可以参与DNA合成和RNA合成，对于红细胞的形成也有一定的作用 。
针对周围神经病变，甲钴胺效果优于维生素B12,因此不推荐维生素B12替代甲钴胺。 针对因缺乏维生素B12引起的巨幼红细胞贫血，两者效果相当，可以相互替代使用 。
