1、位置：厦门站位于厦门市思明区，是离市中心最近的火车站；而厦门北站位于厦门市湖里区，距离市中心相对较远。
2、规模：厦门站规模较小，主要用于办理短途列车和动车组列车的停靠；而厦门北站规模较大，是中国铁路高速列车的枢纽之一，承担着中长途高铁、动车组列车以及城市轨道交通等交通方式的转换任务。
3、功能：厦门站主要以客运为主，提供火车票购买、乘车等服务；而厦门北站除了客运外，还兼具货运功能，是厦门市重要的物流枢纽。
4、线路：厦门站的线路相对简单，主要是连接福建省内其他城市的列车；而厦门北站线路较为丰富，连接了全国各地的高铁和动车组列车，方便旅客出行。
