果蝇和苍蝇虽然都属于蝇科昆虫，但它们之间存在一些明显的区别，从形态上看，果蝇体型较小，通常只有2-3毫米长，而苍蝇体型较大，一般在4-5毫米左右，果蝇的翅膀通常呈透明或半透明，有蓝色、紫色等颜色，而苍蝇的翅膀则是完全透明的。
在生活习性上，果蝇和苍蝇也有所不同，果蝇主要以水果、腐烂的有机物等为食，因此常出现在垃圾堆、果园等地方，而苍蝇则主要在腐烂物体、粪便等处繁殖，对环境卫生影响较大，果蝇的繁殖能力较强，一对果蝇在适宜的条件下，一周内可繁殖出数十万只后代；而苍蝇的繁殖速度相对较慢，一般每隔几天才会产卵一批。
在生物学研究中，果蝇和苍蝇也扮演着不同的角色，由于果蝇基因组的简单性和易操作性，科学家们常用其作为实验模型，研究遗传学、发育生物学等领域的问题，而苍蝇则因其复杂的生殖系统和多种基因型的多样性，被广泛用于疾病模型研究，如癌症、神经退行性疾病等。
尽管果蝇和苍蝇都是蝇科昆虫，但它们在形态、生活习性和生物学研究方面都存在一定的区别。
