阿莫西林和头孢都是抗生素，但种类、适用症、副作用和用法不同，阿莫西林是一种最常用的青霉素类β-内酰胺抗生素，是目前应用较为广泛的口服半合成青霉素之一，也是青霉素类药物中抗菌谱比较广的一个，适用于敏感细菌所致的呼吸道感染、尿路感染、胆道感染、皮肤及软组织感染、脑膜炎、血流感染、心内膜炎等，还可以与其他抗菌药物合用***灭幽门螺杆菌，但阿莫西林目前耐药比较厉害，对能够产生β内酰胺酶的耐药性细菌，往往作用效果不明显，如果是较严重的感染，不适合使用阿莫西林。
头孢是一类抗生素，主要有四代，对革兰氏阴性菌的作用逐渐增强，过敏反应较少；阿莫西林是一种青霉素类抗生素，对革兰氏阳性菌的作用强，但容易引起过敏反应，适合呼吸道、泌尿、生殖道的感染。
